多數患者擔心做試管嬰兒時會出現疼痛，尤其是取卵階段。現在隨著輔助生殖技術的發展，全程并無痛苦，不存在疼痛的感覺。目前促排卵藥物越來越人性化，取卵過程多采取靜脈麻醉。麻醉后患者即可在患者睡眠狀態下取卵，通常5-10分鐘即可結束。結束后應立即停止靜脈麻醉，使患者盡快蘇醒。 部分患者主動采取不麻醉的方式進行取卵。若患者陰道本身對疼痛不敏感，進行取卵手術通常不會出現疼痛不適。但是有些患者卵子數量多，如多囊卵巢綜合征的患者，術后會有疼痛感覺。目前采用人性化方案后，即使卵泡較多，不適癥狀也可得到有效緩解。