肝素屬于抗凝藥物，但并非常規保胎藥物，部分患者使用肝素后可能會改善妊娠結局。使用肝素患者包括血栓全狀態即血液呈高凝狀態、自身合并自身免疫性疾病，此種情況下患者本身處于高凝狀態，建議患者在移植后使用小劑量阿司匹林聯合低分子肝素進行治療。此時使用肝素后比不用肝素患者妊娠結局存在明顯改善，但如果患者處于較好狀態時，生殖科醫生也不會將肝素作為常規保胎藥物。如果患者出現反復著床失敗、反復妊娠丟失時，存在文獻報道此類患者應用低分子肝素時對妊娠結局具有改善作用。如果患者進行反復種植后，出現不明原因的不易著床情況，也可加入低分子肝素，此種情況下應用原因目前在醫學手段上可能沒有被發現。此外，可能利用肝素非抗凝作用，促進胚胎著床、抑制絨毛、抑制滋養葉細胞凋亡。