腎囊腫的原因不清楚，因為所謂腎囊腫就是囊里的水，發生機理可能因為腎臟除了小球底下都是管道，管道擴張后里面包的水容易形成腎囊腫，不管是男性還是女性，具體原因不清楚，也有特別的遺傳性囊腫的原因。 臨床上發現腎囊腫隨著年齡增長，發生率增加，年紀越大腎囊腫發生的機會越多。而且腎囊腫本身是良性疾病，很少發生惡變，通常臨床上讓患者每年復查一次B超即可。