甲亢患者在治療甲亢的過程中，抗體水平就會逐漸有所回落，但通常難以恢復到正常。甲亢如果是由于自身免疫導致，通常是患者存在自身免疫性的甲狀腺疾病，尤其是較常見的格雷夫斯病。格雷夫斯病患者體內存在促甲狀腺激素受體抗體，這些抗體水平在患者病情沒有控制時較高，隨著口服抗甲狀腺藥物的治療，甲狀腺功能逐漸恢復到正常，患者的抗體水平可能會逐漸下降。另外，有些患者在使用碘-131治療甲亢或者手術治療甲亢時，抗體水平也會逐漸出現回落。甲亢患者體內通常還會存在甲狀腺過氧化物酶抗體、甲狀腺球蛋白抗體，這也都是自身免疫的一種表現，這種自身免疫的表現通常并不會隨著甲亢的治療好轉而完全消失。所以要客觀地對待抗體的水平，抗體水平的存在只是提示一個發病機制的存在。在平時主要還是監測甲狀腺的功能，最主要的目標是要將甲狀腺功能控制在正常范圍之內。因為甲亢患者如果T3、T4永遠處于一個高水平，對機體會造成各個系統的損害，有些患者甚至會由于一些心臟問題，導致一些不良情況發生。