HPV31型陽性說明發生HPV31型病毒感染，HPV感染目前尚無藥物可以徹底清除病毒，不管哪種類型的病毒，都沒有藥物可以完全將病毒清除。目前臨床常用針對HPV的藥物是重組人干擾素α2b凝膠，可以起到干擾病毒合成的作用，但是不能起到完全清除病毒的作用。還有一些手段，包括蛋白生物凝膠、光動力治療等，都對HPV有一定的清除作用，但是仍然無法達到完整完全清除病毒的作用。因此HPV31型陽性的患者首先要排除宮頸癌、宮頸上皮內病變、生殖道尖銳濕疣。如果沒有任何的宮頸細胞學改變和組織學改變，也沒有生殖道尖銳濕疣的表現，單純的HPV31型病毒感染可以先不予治療，尤其是年輕女性，多數可以通過自身免疫力將病毒清除，0.5-1年之后再進行HPV復查。在此期間，可以通過鍛煉身體增強機體抵抗力，也可以使用重組人干擾素α2b凝膠輔助清除病毒。