兒童看肛門掛的科室要根據醫院分科程度來決定，比如縣市級醫院可能沒有小兒外科，此時可以掛普外科、小兒內科，如果分科比較細，可以掛肛腸科，如果在省一級醫院或者更大級別的醫院，分科比較細，也可以掛小兒外科、小兒肛腸外科。另外也要看兒童肛門是什么疾病，比如肛門處有肛裂，或者有血便，則可以掛普外科、小兒內科。如果是因為排便困難、肛門狹窄或者先天性巨結腸，長期便秘、排便困難、腹脹，此時可以掛普外科、小兒外科進行檢查，以排除兒童先天性巨結腸或者肛門狹窄、肛門直腸畸形等少見情況。因此，兒童看肛門掛什么科室，要根據當地醫療發展狀況決定，可以掛小兒內科、普外科。如果當地醫療狀況比較好，可以掛小兒肛腸外科、小兒外科，甚至小兒外科里的肛腸組主任，根據兒童的情況來進行不同治療。