關于腎結石發生的病因目前并不清楚，因為腎結石發病的病因非常復雜，通常把這些病因進行歸納以后，分為以下4大類：1、外界因素：包括自然環境、天氣等；2、個體因素：如個體的飲食嗜好、飲食結構以及是否合并其他系統的疾病等；3、泌尿系統的問題：是指個體泌尿系統是否存在梗阻、感染等疾病；4、尿液中的成石因素：通常是在外界因素、個體因素以及泌尿系統因素的共同作用下，導致尿液中成石因素的方面增強，而抑制因素減弱，從而導致尿液中有形成分的析出。這種有形成分最早是結晶，隨著結晶的進一步發展，會造成結石的發生。所以結石分成兩部分，一部分是結晶，大概占97%，另外一部分是基質。通常根據結晶體的不同，將結石進行分類，根據結晶體的不同，將其分為含鈣的結石、尿酸結石、胱氨酸結石和感染結石，通常可以是單一成分，也可以是復合成分。