六神丸治療急性咽炎與慢性咽炎均無確切療效，未經過任何規范的臨床研究證明，所以不建議使用。盡管說明書上標明可治療咽喉炎，但實際上并無規范臨床研究結果證實支持，并且說明書上標明不良反應尚不明確，說明藥物對于自身的不良反應沒有深入研究，所以用藥不但無效，還存在較大風險。慢性咽炎需根據發病原因、病情輕重程度、持續時間長短采取有針對性的治療措施，才可取得較好的療效。慢性咽炎與胃酸、胃液的反流刺激相關，即是反流性咽喉炎導致。由于部分患者并無反酸感覺，故得不到及時、有效的治療，從而會使反流性咽喉炎的咽部異物感、堵塞感、燒灼感等癥狀持續不愈，逐漸形成慢性鼻炎。此時可使用抑制胃酸的藥物進行治療，可取得較好的療效。