中樞神經敏化，在臨床上常用以下的辦法進行治療：1、藥物治療：可以選用的一線藥物，包括加巴噴丁和普瑞巴林，以及卡馬西平、奧卡西平等。這些藥物可以阻滯鈣離子通道，以及鈉離子通道，對于動作電位的興奮性有一定的抑制作用。同時也間接地改善了中樞敏化。其中加巴噴丁和普瑞巴林是首選藥物，其副作用比較小，對于中樞敏化的改善也比較好。伴有嚴重焦慮抑郁的患者，可以選擇選擇性-5羥色胺再攝取抑制劑，包括帕羅西汀、艾司西酞普蘭、舍曲林、伏沙明等。而SNRI類，即5羥色胺和去甲腎上腺素雙通道的調節劑，包括文拉法辛、度洛西汀等，對于中樞敏化也有一定的抑制作用。這些藥物可能是通過，抑制的交感神經的活性，調節5羥色胺和去甲腎上腺素的神經遞質的相對濃度，來改善中樞敏化；2、物理治療：例如針灸治療，以及一些康復訓練，對于中樞敏化有一定的改善；3、手術治療：嚴重的中樞敏化，比如頑固的軀體疼痛，還可以考慮進行微創手術、神經阻滯療法。