霉菌性陰道炎的發病機制其實絕大多數都是內源性，因為在女性的陰道內、腸道內以及口腔內，都有可能會有真菌的存在。在女性抵抗力、免疫力下降時，就有可能會出現異常的增殖動態。陰道內原有的細菌病原體處于微生態平衡環境中，只有當平衡被打破，才有可能會有厭氧菌或者假絲酵母菌等等條件性的致病菌，也就是說一定是在某種環境平衡被打破時才會發病。無論是否有過性生活的女性，都有可能會有霉菌性陰道炎，也就是外陰陰道假絲酵母菌病。但是如果是頻繁進行性生活，有可能會加重霉菌性陰道炎的反復發作。因為當性生活時，由于外生殖器的摩擦、刺激，會導致陰道內環境出現一過性的平衡被打破，因此原有的條件致病菌在這時也會更加容易發病。除此以外，更多的是女性由于應用了廣譜抗生素、免疫抑制劑，或者女性屬于妊娠期、患有糖尿病等，將會更容易患外陰陰道假絲酵母菌病。還有一些就是由于自身的衛生條件欠佳，沒有特別的注意外陰、陰道的內環境保護，應用了沒有完全消毒、被污染的毛巾、浴巾、馬桶坐墊等，也容易導致間接性的傳播。