大便取樣后應盡早進行化驗，取大便后最長不超過30-60分鐘進行大便化驗。化驗大便取樣后應立即檢查，因為隨著時間延長，大便會受到細菌、病毒影響，從而影響檢測結果，由于存放時間過長，可能會導致病原體失活，增加檢出難度。臨床上大便化驗是較方便、易行的檢測方法，能夠間接反應胃腸道疾病。化驗大便是一個必備檢查項目，能夠很好提示胃腸道是否存在疾病，化驗大便主要看大便性狀，是否有黏液、膿血，同時觀察是否有病原體，包括原蟲等，放大鏡下可觀測大便是否有紅細胞、白細胞以及膿細胞等。所以通過大便初步化驗，基本能斷定胃腸道是否有病原體感染，如括細菌、寄生蟲感染等，為進一步檢查和治療提供依據。