目前關于自閉癥的診斷沒有特異性生物學標記物，故自閉癥診斷和評估比較困難。醫生主要通過觀察個體行為、發育診斷，評估認知水平、語言能力，適合年齡日常技能來判斷，因此一定要找到具備診斷能力的專科醫生。一般來說，各地省級兒童醫院、婦幼保健院、精神病院兒科，及綜合醫院兒科都可診斷孤獨癥。若懷疑孩子患有自閉癥，可選擇三級、二級醫療機構，掛兒童保健科、發育行為兒科、兒童康復科、少兒心理或者兒童精神科等。 而很多自閉癥孩子的家長會病急亂投醫，在網絡上尋找機構或醫院，故建議家長在診斷評估前到正規醫院就診，因其訓練大部分是在醫院或專門自閉癥康復機構，所以家長需深入了解，評估機構師資力量。