中藥可以幫助巧克力囊腫患者改善癥狀，但可能無法使囊腫縮小甚至消失。巧克力囊腫屬于子宮內膜異位癥病變，是指卵巢附近出現異位子宮內膜，由于子宮內膜每個月會隨著月經期而脫落，如果在卵巢附近形成陳舊性出血，長期聚集可形成巧克力囊腫。巧克力是指囊腫的顏色，因為囊腫內部有大量陳舊性出血。中藥治療巧克力囊腫時，主要著重于緩解巧克力囊腫造成的嚴重痛經和不孕癥狀，但部分患者通過中藥調理順利懷孕后，由于孕期10個月和哺乳期內均沒有月經來潮，巧克力囊腫可能會自行萎縮。