膽囊結石和膽管結石成因幾乎相同，而且膽囊結石經常掉落到膽管形成膽管結石。從解剖上特別容易理解，膽囊結石導致膽囊壁摩擦，引起慢性膽囊炎。若堵塞到膽囊頸部，可引起急性膽囊炎發作，膽囊壁會充血、水腫，膽囊增大，出現右上腹疼痛、發熱等情況。若結石掉落到膽總管或者本身是膽總管形成的結石，會堵塞膽管，這時不只發生膽囊炎癥，而且膽汁排泄也會出現問題，會出現梗阻性肝炎。這時患者會出現黃疸，是膽紅素增高，然后肝功能、轉氨酶增高。 若膽總管結石在壺腹部、乳頭附近，胰管排泄會有問題，出現膽源性胰腺炎，患者淀粉酶、脂肪酶會增高，上腹部會疼痛、脹滿。這時B超或CT可看到膽囊腫大、胰腺充血、水腫、膽總管擴張。此時比較緊急需要積極治療，要在內鏡下把膽總管結石取出，如ERCP取石；嚴重情況或患者不耐受ERCP，可能選擇外科手術治療。