眼角膜移植手術相比于全身其他器官移植手術，成功率最高，對于條件較好的病人，成功率在90%以上，比如圓錐角膜患者、角膜營養不良患者、感染或外傷導致角膜白斑的患者，相對角膜血管較少，角膜移植術后排斥、并發癥發生的幾率較低，所以成功率較高。 對于有些患者，比如眼表化學傷或熱燒傷等較嚴重的患者，或全身的免疫相關性疾病引起角膜血管性瘢痕的患者，因為角膜血管較多，相對術后排斥幾率較高。此外，全身的免疫性疾病，如類風濕關節炎，可能術后也易發生角膜溶解，相對移植成功率較低。