陰道炎通常是由于陰道菌群紊亂所導致，對于不同類型的陰道炎，病因有所不同。正常情況下，陰道處于以乳酸桿菌為主的生態平衡狀態，陰道上皮細胞產生糖原，并在乳酸桿菌作用下分解，產生乳酸，維持陰道的弱酸性環境。這時，很多致病菌的生長會受到抑制，即可維持陰道正常環境。但當其他外界條件出現，造成陰道內生態平衡被破壞，導致致病菌過度生長，就會出現陰道炎。細菌性陰道炎，是由于條件致病菌過度生長所導致。霉菌性陰道炎是由于念珠菌導致，念珠菌是條件致病菌，即正常情況下，念珠菌會受到陰道環境的抑制。但在特殊狀況下，如長期使用抗生素、免疫抑制劑、血糖異常時，會導致念珠菌過度生長，從而出現霉菌性陰道炎。滴蟲性陰道炎，通常是由于感染陰道毛滴蟲導致。