若進行腸鏡時發現息肉較小的情況下，可以進行切除。但在切除息肉前需留取活檢，即取出壞組織送病理檢查。切除息肉后無法保證能夠將息肉送病檢，所以為預防意外，應在切除息肉前取組織進行活檢以備用。但若息肉較大，為防手術后出現嚴重的并發癥，建議患者住院后在腸鏡下切除息肉進行檢查。若在腸鏡檢查過程中發現息肉的狀態不良，無法確定為良性息肉，也應盡量取活檢，等待病理檢查結果后再予以進一步治療。若病理結果為良性息肉，可以進行腸鏡下切除；若病理結果為惡性，也可以在腸鏡下進行切除。但與良性息肉的切除方式存在差異，切除惡性組織時，范圍通常會更大。因此若在腸鏡檢查過程中發現息肉，通常可以直接予以切除。