若患者沒有基礎心臟病，且房顫近期才發生，特別是陣發性的房顫，及早去做射頻消融術可以得到根治。 射頻消融導管到達心臟，在局部釋放射頻波，使得房顫的原因消除，成功率大概可達到80%。少部分病人可能會不成功或復發。藥物治療嚴格來說不能根本治療，例如常用的胺碘酮，是預防類藥物，需要長期吃。而且胺碘酮并不是一定能夠預防發作。 如果病人已經為持續性房顫患者，則只能用藥物去預防，使心率不要太快。如地高辛或β阻滯劑類的藥物，可預防其心室率過快，只能達到預防目的。