功能性腹脹通常會由于飲食、生活習慣或壓力、精神因素引起，部分情況下會繼發于較嚴重的急性胃腸炎，若將誘因去除，則患者的功能性腹脹存在自愈的可能。若患者近期壓力較大導致出現腹脹癥狀，當壓力解除后腹脹癥狀有所緩解，則說明功能性腹脹自愈，但并非所有的功能性腹脹均會自愈。若患者持續出現腹脹，建議到醫院就診并排除器質性原因，可以在醫生指導下調節飲食及生活習慣，或使用藥物以使癥狀得到改善。若癥狀持續不好轉，患者還需積極尋找病因。此外，患者可能需進行藥物調整，甚至使用神經調節劑進行治療。