卵巢囊腫可能發生惡變，所以出現卵巢囊腫，要注意觀察，如果長得較快則懷疑有惡變的可能。年輕人也有卵巢囊腫惡變的可能，40歲以上的女性，如果囊腫持續增大，也考慮惡性的可能。部分子宮肌瘤在絕經后會逐漸萎縮，可以不進行手術治療，但是卵巢囊腫在絕經后繼續存在，則基本不會自行消失，可能會突然增大，發生癌變。當發現卵巢囊腫和腫瘤時，要考慮手術治療，少部分卵巢囊腫是生理性囊腫，進行觀察即可。如果囊腫時大時小，尤其與月經有關，即月經前大、月經后小，基本是良性，或者反應性，或者生理性囊腫。如果囊腫雖然時大時小，但是一段時間后逐漸增大，可能是良性囊腫，需要進行手術治療。如果是超過6cm的囊腫，幾乎不能自行消失，需要進行手術治療。