無論是人工流產，還是藥物流產，對身體均有一定損害，甚至可能造成永久性、不可逆的后遺癥，但多數不會出現，沒有較好的方法界定藥流對身體的損害值。一般流產結束后出血可能面臨感染的風險，需要使用抗生素預防感染。藥流后如果出血時間較久，繼發感染造成宮腔粘連，導致不孕、繼發月經不調等的概率大于人工流產。多數人出現以上后果均為可逆性過程，可以得到恢復，但也有較少部分難以恢復，例如臨床上可見部分人進行1次流產后再也無法懷孕。建議盡量不進行流產，如果一定需要進行，應選擇正規的公立醫院，做藥流的同時也做好手術的準備，并且在術后2周左右進行常規復查，明確是否流干凈。另外，流產后有任何不適，例如出血多于月經或劇烈腹痛等，及時至手術醫院就診。