光子脫毛的原理是光子的能量通過毛發進入毛囊，破壞毛囊達到脫毛的效果。光子脫毛基本沒有副作用，但如果光子能量過大，使毛囊周圍的皮膚有輕微的灼傷或燙傷，可能會使皮膚出現一些小的紅腫顆粒，但這種現象很快就會消退。 所以，在光子脫毛時一般推薦使用冰點光子脫毛，在脫毛之前和之后進行冰敷，可以使光子脫毛的副作用減為零。且光子脫毛時，只有長出毛發的毛囊才可能會被光子損傷，而沒有長出毛發的毛囊，有可能還會存在，也就是需要等到一個月之后毛囊長出毛發，再進行一次脫毛，才能達到效果。