慢性咽炎引起的舌根濾泡增生的治療主要是采用藥物治療。引起慢性咽炎舌根濾泡增生的主要原因是咽喉反流，由于長期的咽喉反流刺激，引起舌根濾泡增生。治療具體如下：1、抑酸藥：如雷貝拉唑、奧美拉唑、泮托拉唑等質子泵抑制劑；2、胃腸動力藥：如枸櫞酸莫沙必利等；3、中成藥：如丹參酮膠囊、腫痛安膠囊等；4、低溫等離子治療：如果患者慢性咽炎造成的舌根濾泡增生比較嚴重，引起睡眠呼吸暫停綜合征，可以嘗試用低溫等離子治療。其機理是在黏膜下燒灼濾泡，使其縮小，緩解上呼吸道梗阻情況；5、加強身體鍛煉：部分患者由于急性炎癥反復發作，如急性上呼吸道感染、急性咽炎，也會造成濾泡增生。這種情況就要加強身體鍛煉，減少急性炎癥的發生率。