目率前列腺增生通常選擇微創手術，如經尿道前列腺電切術或激光剜除術，對病人創傷較小，后遺癥出現也較少。近期后遺癥通常是血尿、尿頻、尿痛，遠期后遺癥最嚴重為尿失禁，但比率較低，有研究報道1‰病人可能會出現尿失禁。尿失禁病人手術時需保持尿道外括約肌不受損傷，病人術后短期會出現功能性尿失禁，3個月后，最長0.5-1年后尿失禁恢復，變為正常控制排尿。一旦1年以后仍尿失禁，即為器質性尿失禁，比較難治療。此外，術后后遺癥包括性功能障礙，最常見逆行射精，病人有射精感覺但無精液出現，約25%會出現勃起功能障礙。