新型冠狀病毒感染和咽炎有很多差異，想要區分二者，最根本的可能還是通過新型冠狀病毒核酸檢測。因為單純從癥狀來區分，二者會有重疊，最終的診斷還是靠實驗室檢查。如果新型冠狀病毒核酸檢測陽性，則可以診斷為新型冠狀病毒感染，如果是陰性，就可以排除新型冠狀病毒感染。這兩種疾病的病因差距也很大，如新型冠狀病毒感染可能會有咽部的癥狀，就是來源于病毒感染。而咽炎有很多原因，可能是病毒感染，也可能是細菌感染，其中病毒感染可能是其他的普通感冒病毒，或者是一些甲流、乙流等流感病毒等，各種病毒都可能會引起咽炎。此外，非特異性因素，如可能一些煙、酒的刺激，包括一些辛辣食物的刺激等，也可能引發咽炎，所以二者病因方面差異很大。在癥狀方面，新型冠狀病毒感染以后，可能會表現為單純的咽部不適，也可能會引起全身各個系統受損的表現。而咽炎的主要表現就集中在咽部不適的癥狀，治療上的差異更大。