金匱腎氣丸與濟生腎氣丸，主要的區別在于藥物組成和功效上，具體如下：1、藥物組成：金匱腎氣丸是在六味地黃丸基礎上加附子、桂枝所成，全方由附子、桂枝、熟地黃、山藥、山茱萸、茯苓、丹皮、澤瀉八味藥物組成，有時也稱之為八味腎氣丸。濟生腎氣丸是在六味地黃丸的基礎上加附子、肉桂、車前子、牛膝所組成，所以也稱之為牛車腎氣丸；2、功效：金匱腎氣丸的主要作用是溫補腎陽，可以用來治療腎陽虛證的患者。濟生腎氣丸由于含有牛膝、車前子等藥物，在溫補腎陽的基礎上又具有化氣利水的功效，可以治療腎陽不足，同時還可以治療肢體浮腫的表現。