綠膿桿菌感染一般首選藥物不固定，因為綠膿桿菌在不同的醫院以及不同的科室，敏感性差異非常顯著，即使在同一家醫院，不同的科室，敏感性差別也非常大。所以一般會根據本科室以往綠膿桿菌的敏感性，經驗性地選擇用藥。通常可以從以下幾類藥品當中選擇：1、頭孢類藥物：可以選擇，頭孢他啶或者頭孢匹羅，目前也出現了一定程度的耐藥；2、β-內酰胺酶抑制劑：一般首選頭孢哌酮/舒巴坦或者哌拉西林他唑巴坦；3、喹諾酮類藥物：一般首選環丙沙星，環丙沙星相較于其他的氟喹諾酮類藥物，對革蘭陰性桿菌作用比較強，尤其對于綠膿桿菌，比其他的氟喹酮類藥物作用顯著；4、碳青霉烯類藥品：可以選擇美羅培南或者亞胺培南，這兩類藥物對于綠膿桿菌既往敏感性非常強，但最近耐藥性也在逐漸增加，所以應用碳青霉烯類的藥物也有無效的病例。