最容易長咽喉囊腫的部位，如扁桃體、咽側壁、會厭、喉咽部的側壁上。咽喉囊腫的治療，需要結合囊腫的大小來分析：1、暫時觀察：這種情況下，多數病人基本上沒有任何臨床癥狀。像扁桃體的囊腫，通常病人是在張口照鏡子的時候發現。在會厭、喉咽部、側壁的囊腫等，這些是病人在查體或者是在做電子喉鏡的時候發現。對于沒有任何臨床癥狀的囊腫，可以觀察，不需要任何處理；2、手術治療：如果咽喉囊腫比較大，可能會引起異物感，進食的時候或者空咽的時候都會有異物感。另外，在囊腫長大以后，會影響進食，造成吞咽困難。尤其是會厭當中的囊腫比較大，在進食如饅頭或者米飯的時候，可能就會有腫脹感。此外，咽喉囊腫巨大，可能會引起呼吸困難。出現了臨床癥狀，通常需要手術治療，藥物治療基本上沒有效果。