肝囊腫的診斷通常要借助影像學檢查，查體時做B超，如果B超上能發現圓形或者類圓形的、邊界非常清楚、回聲較低的，這種情況通常就可確診為肝囊腫。某些肝臟的囊性病灶還會出現包括囊腺瘤或者不太典型的血管瘤，這種情況肝囊腫就需要進行鑒別診斷。對于鑒別診斷，通常選擇的檢查方法包括CT、核磁，還可通過注射增強造影劑來進一步區分肝囊腫和其它肝臟占位性病灶。對于肝囊腫，它屬于良性疾病，通常如果不是囊腫長到很大，一般不建議進行外科干預，只通過定期檢查就可以。另外，肝囊腫還有個特點是生長較緩慢，進行定期檢查時會發現，每次檢查實際上囊腫增大并不明顯。