心肌損傷通常可以恢復到正常狀態，因為心肌炎通常屬于自限性或自愈性疾病，普通型或輕型的心肌炎患者經過一段時間后，心臟可以完全恢復正常。甚至急性期重癥心肌炎，多數患者的心臟也可以完全得到修復。另外，新型冠狀病毒肺炎、SARS，或甲流引起的病毒性肺炎，也可以引起心臟損傷，但隨著患者的原發病完全治愈，心臟損傷常可以恢復正常。但若心肌損傷的患者原發病較嚴重，在心肌損傷的急性期，心肌細胞的受損范圍、數量較大，也可能會遺留對心臟的長期損害，如心臟功能下降、心臟傳導系統出現問題。部分心肌炎患者在度過急性期后，可能會遺留有心率過慢、傳導阻滯的問題，或在數年后出現心臟擴大，甚至心力衰竭等表現。