正畸重建咬合實際上是調整上頜牙和下頜牙之間相對應的咬合關系。因為牙齒畸形不僅表現在牙齒不齊，如上頜前突、后縮，更關注的是上下頜的咬合關系，有時咬合關系不正常，如上頜有前突出來，也會后縮回去，下頜也可以前突也可以后縮，上下頜前牙在咬合關系上不良，如上牙蓋住下牙較多，在垂直向、水平向上都可能會出現異常。所以正畸治療是非常復雜的過程，通過牙齒移動來改變上下頜位置關系，使每一顆牙都能和對(牙合)兩顆牙齒達到尖窩鎖結的咬合關系，可以使上下前牙在垂直向覆(牙合)達到上牙蓋住下牙1/3的水平，前牙蓋住下前牙的水平距離不超過3mm，這樣才可能達到理想的咬合，也可以恢復最大的咬合功能。