腎盂輸尿管交界處本身存在生理性狹窄，大多數生理性或者先天性狹窄沒有造成積水、腰痛、腎功能下降，不需要進行特殊對待和處理。對于病理性腎盂輸尿管交界處狹窄，要引起重視，常用的對策為經輸尿管鏡下的各種操作，包括局部擴張或激光去除狹窄。對于管腔外或壓迫造成的不適和腎功能下降，要借助于腹腔鏡等各種措施進行對應的處理。 腎臟有較多血管供應，特別動脈，有可能會跨越腎臟與輸尿管交界處，造成局部的壓迫，癥狀明顯者需要處理。還有一種腎盂輸尿管交界處的病理性狹窄稱為UPJO，需要針對狹窄進行整形手術。