大多數的肝囊腫不需要特殊治療。如果肝囊腫比較大，超過5cm或者是10cm，或者是明顯變大伴有囊內結節，不好排除是肝囊腫有惡變，或者是伴有囊內出血、感染，有明顯的癥狀，或者是出現變大之后局部有壓迫癥狀。這些比較特殊的肝囊腫病人，需要到肝膽外科就診，必要時要做微創的肝囊腫開窗引流術。但如果本身肝囊腫大小，沒有明顯變化，不伴有上述的出血、感染或者是壓迫癥狀，只要6-12個月定期在門診復查B超即可，不需要穿刺、做強化CT或者是做手術治療。只要定期復查沒有明顯變化，就不需要到其他科室治療。本身有些治療也會引發相關的并發癥，大可不必因為不需要的手術冒手術相關的風險。