急性的咽峽炎是咽炎的一種特殊類型，主要是指咽峽部的炎癥。懸雍垂、軟顎、舌顎弓與咽顎弓組成了咽峽，咽峽炎是由病毒或細菌導致，病人會有咽干、咽痛、皰疹等。其中最常見的就是皰疹性的咽峽炎，是由腸道病毒或柯薩奇病毒引起的一種急性呼吸道的傳染性疾病，多在6歲以下兒童多見。病人主要表現為咽痛、發燒以及咽峽部的皰疹，一般皰疹在2-3天破裂，在1周左右愈合。通常治療主要首先進行隔離，處理病人接觸的物件或者是吃過的食物。同時皰疹性的咽峽炎病毒沒有特異性的抗病毒藥物，可以用干擾素α進行噴霧，對于高燒的病人要進行降溫，包括物理降溫或藥物降溫。病人多數在1周左右就能痊愈，只有少數病人會出現腦膜炎、心肌炎等很嚴重的并發癥。