一般胚胎移植2天后才會著床，而如果移植第3天的胚胎，會導致試管嬰兒胚胎移植后有宮外孕的風險。期間胚胎會在宮腔內游走，甚至游走到輸卵管內。如果輸卵管功能正常，會將胚胎運送到宮腔內，但如果輸卵管功能有異常，胚胎可能會在輸卵管內種植，則造成宮外孕的風險。如果是囊胚移植，宮外孕的風險會比移植第3天的胚胎明顯降低，因此有反復宮外孕病史的患者可以選擇進行囊胚移植。因為囊胚移植之后很快著床，減少游走的時間，同時也降低了宮外孕發病的風險。 另外，胚胎移植后14天抽血驗孕，血HCG值偏低、增長不理想或者出現陰道流血、腹痛情況，也要隨時警惕宮外孕發生的可能性。總之，做試管嬰兒胚胎移植同樣會發生宮外孕。