金蓮花膠囊的成分為中藥的金蓮花，所以在臨床使用時，可以作為金蓮花單味藥入方劑，配合中草藥一起使用。也可以作為清熱解毒的藥，和其他中成藥配伍，有利于抵抗外界病原體。現代研究對這些中草藥的新發現是可以代替中藥有抑菌或者抗病原體的成分使用，就類似以前用板藍根、魚腥草這類藥。在使用此藥物時應注意，此藥屬寒，能清肺胃經的熱，也能清肝經的熱。長期使用寒性藥物，對脾胃有一定影響，所以很少單用這味藥，應與其他中草藥相互配合使用。中醫用藥講究配伍，君臣佐使要相互配合，這是最重要的一點。不是有熱就拿清熱的，是肝病拿治肝的茵陳，是肺炎就加魚腥草，而是將人作為整體來進行辨證，寒熱、陰陽、虛實、表里，通過辨證后，共同組成方劑來治療疾病，金蓮花只是作為其中一個成分。