大豆異黃酮不可以長期、過量地服用，因為大豆異黃酮作為一種雌激素的類似物，有一定的應用適應癥，比如對于更年期骨質疏松的人群，如果適當應用大豆異黃酮，利用其雌激素類似物的作用，能夠發揮出緩解更年期癥狀的作用，對預防和緩解骨質疏松癥狀有積極的作用。如果不加節制，長期、大量地補充大豆異黃酮，就會加重人體肝臟的負擔，進而會使肝細胞發生壞死，甚至會出現腹水情況。大豆異黃酮的代謝產物，也會影響到人體腎臟代謝的功能，使腎功能下降，出現排出尿液減少，造成全身浮腫發生的風險增加。從另外的角度上而言，大豆異黃酮如果不加節制地過多攝入，還會引起癌癥發生風險的增加。因此大豆異黃酮一定要在專業人員的指導下，適量、科學地應用。