多囊卵巢綜合征的女性可通過查性激素六項了解基礎內分泌，檢查時間主要取決于檢查目的。為觀察基礎狀態，一般安排在月經來潮的第2-5天，早晨10點前空腹進行檢查，如果是其他目的，需根據目的決定抽血的時間。基礎狀態的性激素六項檢查是為觀察是否存在高雄激素血癥，泌乳素水平是否處于正常范圍，黃體生成素和卵泡刺激素的比例是否已經失衡。除性激素六項檢查外，同時還可以予以抗繆勒管激素檢查，可以代表小卵泡的數目。多囊卵巢綜合征的女性一般抗繆勒管激素比同齡人更高，也預示存在更多的小卵泡數目。如果多囊卵巢綜合征女性查激素的目的不是觀察基礎狀態，比如是觀察孕激素水平，可以安排在排卵后1周抽血檢查。