肺部支原體感染主要是查病原微生物、血清學檢查來診斷，具體如下：1、血清學檢查：肺部支原體感染先有肺部的感染，進行胸片或者CT的檢測，可以發現肺里有炎癥，要想進一步判斷肺里炎癥是否是支原體感染，可以進行查血清學的檢測。比如血清學支原體的IgM抗體如果是陽性，可以診斷肺部支原體感染，若是IgG抗體恢復期血清和早期血清是4倍以上升高，也可以診斷是支原體感染；2、查病原微生物：通過病原微生物的檢測，可以查痰或者是經支氣管鏡的支氣管肺泡灌洗BALF式液體，下呼吸道的分泌物或者是灌洗液檢測病原微生物，即支原體核酸的檢測，支原體快速培養法來檢測。支原體的分離培養可以做檢測，一般通常用于研究，因為支原體分離培養很復雜，且耗時比較長，需要2-3周，花費也比較貴，通常只是研究才用。現在有快速的培養法也可以監測支原體的感染，通常用這些方法來診斷；3、其他：還有一些臨床方面提示支原體感染比較多，比如有家庭的小流行，尤其是學齡前兒童先感染傳染給大人。學齡前兒童家里有幾個人，或者學校里邊有相對比較集中的幾個人發病，或者臨床上陣發性咳嗽比較重，沒有痰，干咳癥狀比較重，但是影像學其他表現不很明顯。影像學檢查一看片子可能表現比較明顯，或者是有沿支氣管血管束分布的。經過給紅霉素類、喹諾酮類藥物的治療，對非典型支原體病人治療有效，也證明可能是有支原體感染，這些都是臨床支持，結合病原和血清學檢查就可以診斷。