新生兒房間隔缺損的術后并發癥主要如下： 1、外科手術首先考慮殘余分流； 2、在房間隔缺損修補過程中可能存在傳導系統的損傷，從而導致患者心跳減慢或異常； 3、房間隔缺損修補時與左房相通，修補完成后應充分排氣，否則左房內殘余氣栓或血栓會對大腦造成損傷； 4、室上性心律失常：部分患兒術后會出現房性早搏、室上性心動過速； 5、患者心包存在遲發性積液； 6、傷口愈合時發生感染。 上述并發癥在手術后均有發生的可能，但在技術成熟的大型心血管外科中心，隨著術后監護、圍手術期管理、體外循環管理、麻醉管理的逐漸完善以及外科手術技術的提高，手術成功率總體較高。