十二指腸潰瘍實際在內鏡下有分期的標準，分為AHS，分別表示A期是活動期，H期是愈合期，S期是瘢痕期，病變從A期至S期逐漸變輕，每一期可以再分為A1和A2、H1和H2、S1和S2。通常潰瘍A期時，在鏡下除可以觀察到潰瘍外，還會描述為潰瘍周圍的黏膜充血、腫脹或者接觸易出血，通常表示潰瘍較為嚴重，隨時可能進展更為嚴重，導致消化道出血、穿孔的風險更高。隨著使用的PPI藥物(質子泵抑制劑類藥物)，即抑制胃酸的藥物，以及保護胃黏膜的藥物以后，潰瘍逐漸修復。另外，可能機體自愈后，會出現愈合期，這時潰瘍的創面較小，周圍的水腫炎癥較輕。最后可以觀察到潰瘍愈合以后形成白色瘢痕，就稱為瘢痕期。總而言之，分期通常可以提示醫生此時潰瘍的程度，進而選擇合適的治療方法，并且控制治療的療程。