甲狀腺乳頭狀癌整體預后比較良好，通常生存時間比較長。甲狀腺乳頭狀癌也會出現類型轉變，有些甲狀腺乳頭狀癌隨著時間推移，也可演變成未分化癌。 未分化癌在甲狀腺癌里面預后非常差，總體生存時間比較短，對于絕大多數的甲狀腺乳頭狀癌預后相對比較好，有10年或20年，甚至更遠期的生存時間。另外，還與年齡、淋巴結轉移情況、腫瘤大小密切相關，對于微小癌，預后整體相對比較好，而年輕的甲狀腺癌患者生存時間比較長。