如果膽總管囊腫及時通過手術治療，不會影響患者壽命，如果沒有通過手術處理，膽總管囊腫癌變以后，會嚴重影響患者生命。膽總管囊腫是先天性疾病，在胚胎發育過程中，因為膽管壁發育不良，導致膽總管囊性改變，囊腫可以長得到十幾厘米，甚至20cm。膽管下端常因為發育不良表現為牽痛創，膽總管囊腫在小孩中比較多見。如果沒有得到及時有效的手術治療，反復膽汁淤積會誘發膽管炎癥，從而促使囊腫壁出現癌變。一旦發生癌變，會嚴重影響到患者的生命。膽總管囊腫本身是良性疾病，如果變成惡性腫瘤，其治療與預后就會變得比較糟糕。如果通過及時有效的治療，手術切除囊腫，將膽道進行膽臟的內引流的處理，使膽汁用過人工手段流動，使其恢復正常，就不會影響到患者的生命，患者的生活質量與生命都會表現為正常。