女性泌尿系統感染如果伴有腰疼，考慮存在有上尿路感染。對于上尿路感染，要求應用強有力的抗菌素進行治療，因為上尿路感染的全身癥狀較重。可以根據尿培養的結果來選擇敏感抗菌素，同時在具體用藥的選擇上面，一般推薦半合成青霉素、第三代頭孢菌素、第三代喹諾酮類抗菌素以及氨基糖苷類抗菌素等。用藥的方式一般為靜脈應用，用藥周期為10-14天，癥狀控制后應當繼續口服藥物進行治療，治療周期為2-4周，通過此類強有力的抗感染治療來控制上尿路感染。同時對于腰疼要鑒別是否存在其他原因所導致，主要是梗阻性問題。梗阻性問題可以造成積水而引起上尿路感染，常見的是結石，其他的還包括先天性發育異常等。處理的原則是解除梗阻，大多數情況下需要手術治療，如有結石時要進行內鏡下的碎石取石治療。