后腦勺一陣一陣的疼痛有以下一些原因：1、這種情況首先建議關注頭顱本身的問題，頭后腦勺部位是椎基底動脈的部位，也是小腦腦干的部位。所以建議行頭顱核磁共振檢查以及頭顱血管核磁共振檢查，明確是否有腦干、小腦的腦出血、腦梗塞以及腦腫瘤、轉移瘤、血管畸形、血管瘤破裂等器質性病變；2、另外后腦勺陣發性疼痛也可能會是由于帶狀皰疹病毒侵犯神經引起的陣發性疼痛，這種疼痛是陣發性的針刺痛或者是刀割痛，這種疼痛可以通過神經阻滯來緩解；3、另外就是頸椎病，頸部的軟組織病變引起的疼痛。但是建議行頸椎核磁共振檢查，明確是否有延髓的病變以及頸椎椎體的病變，如轉移瘤、結核等，這種器質性病變也會引起后腦勺的陣發性疼痛癥狀。