大腦神經修復最佳的方法是去除病因，神經營養的藥物的應用以及康復訓練等。造成大腦神經損傷的原因很多，如果是炎癥性的，給予抗感染治療或者抗病毒治療。如果是外傷性，可以進行手術的神經修復，如果是免疫性，可以用免疫球蛋白或者激素的治療，改善和促進大腦神經的修復，一般主要針對病因進行治療。還有一部分針對神經營養的治療，神經營養的藥物主要包括神經節苷脂、鼠神經生長因子，還有就是甲鈷胺、維生素B1，可以促進神經的修復和生成。用這些藥物以后，可以加快大腦神經的修復。除了這些藥物的治療以外，要給予康復的訓練，目前認為對于一部分的神經是不可逆的。對于不可逆的神經，就是通過康復的方法來改造，或者原來已經存在的正常神經組織，通過神經的突觸形成，也叫突觸的可塑性，再造一個神經環路來支配原來已經散失或者壞死的神經，替代原來的神經的功能。有可能重新生成的神經突觸，沒有原來的神經突觸靈活好用，但是可以替代大部分的功能，而起到一個康復的作用。