肺靜脈異位引流手術后的并發癥，可簡單分為近期并發癥和遠期并發癥。近期并發癥同多數與心臟手術類似，可出現早期心臟切口出血、呼吸道梗阻、肺部感染、急性腎功能衰竭等。由于完全型肺靜脈異位引流可引起左心功能受限，心臟內畸形矯正后，左心負擔增加，還需注意維護心臟功能。 遠期并發癥常見于重建肺靜脈和左心房吻合口狹窄，導致血液回流受限。因此在術后一段時間內，需密切監測吻合口、左心功能及左心結構的具體情況。