肛瘺手術不要求無菌，因創口本身屬于污染性有菌創口，故每次換藥或者自行清洗時，不需要把肛瘺創口清洗到無任何分泌物，否則容易導致疼痛。肛瘺術后往往需要用清熱解毒的中藥坐浴，把肛瘺創口泡到藥水里進行清洗、坐浴，每次20分鐘。術后第1周，高位肛瘺一天坐浴2-3次，輕度的肛瘺一天坐浴1次即可。 肛瘺術后坐浴能達到清洗傷口、清熱解毒、減少炎性分泌物刺激創口的作用，所以是肛瘺術后最重要、最好的護理方法。肛瘺手術創口與瘺管大小有關，小瘺管創口比較小，但大瘺管或者高位復雜性肛瘺創口非常大，分泌物非常多，尤其是在高位掛線的肛瘺，而且非常臭。總而言之，肛瘺術后創口沒必要擦得非常干凈。