碘-131治療的利弊分為兩種疾病，碘-131治療甲亢以及治療甲癌。甲亢應用放射性同位素治療，療效非常確切，安全性高、治愈率高、復發率低，這些特點被人們越來越接受了。但治療方法也有不足之處，讓很多人沒法接受的最大的問題，是相當一部分甲亢患者會在治療之后轉變成甲狀腺功能減低，需要長期補充甲狀腺激素。補充的甲狀腺激素就是甲狀腺自身分泌的一種激素，吃進去甲狀腺激素之后，人體內有時候沒辦法分辨出是自身分泌還是服藥，非常安全。甲亢患者不管用什么方法治療，都有甲狀腺功能減低的可能，據統計每年是有3%的幾率發生此情況。甲狀腺功能減低相對于甲亢來說非常容易診斷和治療，只要服藥恰當和健康人沒有什么不同。 甲狀腺癌的治療，只要是分化型甲狀腺癌就需要用同位素碘-131治療，好處就是治療必須所需。但治療之后有可能對患者的唾液腺產生損傷，發生嘴干的癥狀，都可以在治療之后服用維C或者嚼口香糖、吃含酸性的糖果之類預防。總的來說，碘-131治療甲亢或者癌還是利大于弊。