肛周膿腫的較好治療方式為手術治療，但在感染早起也可進行保守治療，主要內容如下：1、手術治療：明確形成肛周膿腫且存在膿液時，手術為較佳的治療手段；2、保守治療：肛周感染早期可形成局部硬塊但無膿液，患者會出現疼痛癥狀，此時可行消炎治療，包括口服抗生素甚至靜脈輸注消炎藥、抗生素等配合物理治療，如肛門坐浴清潔、消毒，以及局部外用膏劑或栓劑進行消炎、消腫，部分患者可得到較好緩解。膿腫形成后通常保守治療效果較差，部分可導致癥狀加重甚至破潰形成肛瘺，故而建議患者進行手術治療，可有效控制感染及疼痛癥狀。部分肛周膿腫甚至可將內口一并進行處理，避免形成肛瘺。